起运港与企业不在一个城市的意思是指在我们出口贸易活动中，会有公司在一个城市，但是在其他城市的港口发货，比如：上海公司，天津出货这样的情况，那企业就会比较纠结产地证应该是在公司所在地办理，还是在起运港的城市办理，那让小编来为您解答：

1、首先这种情况企业申请原产地证可以在企业所在地办理，可以在发货地办理。

2、其次企业如果自己办理的话，不管您在企业所在地办理还是发货地办理，都是需要先到当地的海关及贸促会进行备案，这个因素不利于企业选择自己在发货地办理，因为发货地是不固定的，随时都会有变动，不可能每一个发货地都进行备案。这不现实。

3、后原产地证是可以由第三方代理出具，意思就是找代理公司代贵公司出证的意思，代理操作不需要企业进行备案，而且产地证办理本身没有区域限制，只要在大陆境内的海关及贸促会办理的原产地证书，法律效果都是一样的，客户都可以正常使用。